有两个鉴别方法：
一、通过极性强弱来鉴别，顺序：大黄素甲醚＜大黄素。通过 比移值顺序来鉴别：大黄素甲醚＞大黄素。
二、还可以用化学法来鉴别，化学法:如可溶于Na2CO3为大黄素，不溶于Na2CO3可溶于NaOH为大黄素甲醚。因大黄素具有β—OH，酸性稍强，故可溶于Na2CO3，而大黄素甲醚无β—OH，只有α—OH。
色谱法:Rf值大者为大黄素甲醚，大黄素共有三个—OH，极性大，而大黄素甲醚有两个—OH，极性小，故Rf值大。
