孟德尔随机化使用遗传变异作为工具变量，推断暴露因素与结局之间的因果关系，能有效克服混杂合反向因果问题所导致的偏倚。
1986年，Katan提出MR思想：
由于配子形成时，遵循“亲代等位基因随机分配给子代”的孟德尔遗传规律，如果基因型决定表型，基因型通过表型而与疾病发生关联
因此可以使用基因型作为工具变量来推断表型与疾病之间的关联。
① 工具变量Z与混杂因素U无关联
② 工具变量Z与暴露因素X有关联
③ 工具变量Z与结局变量Y无关联，Z只能通过变量X与Y发生关联。
孟德尔随机化中，遗传变异被作为工具变量评估暴露对结局的因果效应，遗传变异满足工具变量的基本条件总结为：
1）遗传变异与暴露有关。
2）遗传变异与暴露-结果关联的任何混杂因素均不相关
3）改遗传变异不会影响结果，除非可能通过化瘀暴露的关联来实现。
