国药健字号和国药准字号所代表的产品不同。国药健字牌是指的保健品，不具备治疗疾病的作用国药准字号是指是药品，具有治疗疾病的作用。国药健字牌和国药准字号产品效果不同。国药健字牌保健品是用于调节机体机能，提高人体抵御疾病的能力，改善亚健康状态，降低疾病发生的风险，不以预防、治疗疾病为目的。
国药准字号药品是指用于预防、治疗、诊断人的疾病，有目的地调节人的生理机能并规定有适应症或者功能主治、用法和用量的物质。国药健字牌和国药准字号产品审批机构不同。国药准字号是指是国家药监局批准的，准予生产的药品。国食健字是国家食品药品监督局批准的准予生产的保健品。
