两者不是同一个概念，但是有异同点。笼统地说，氢动力汽车包含一部分的燃料电池汽车，主要是氢燃料电池车。一般来讲，氢动力汽车指氢内燃机汽车，就是直接把氢气供入气缸燃烧，和传统汽、柴油车没有太大区别。而燃料电池汽车的驱动核心是电动机，它没有发动机。燃料电池的燃料有很多，像氢气、甲烷、乙醇等，主要燃料是氢气，所以燃料电池一般都是氢氧燃料电池，燃料电池将化学能直接转化成电能，再把电能转化成电动机的机械能，没有直接燃烧过程氢内燃机是把氢气的化学能通过燃烧转化成热能和动能，再把这些能量通过往复运动的活塞转化成机械能。
