黄柏常见的病虫害主要有锈病、根腐病与刺蛾、尺蠖、斑衣蜡蝉。锈病可用粉锈宁防治根腐病用70%甲基托布津0.125溶液灌根防治。刺蛾、尺蠖、斑衣蜡蝉用速灭菊脂、阿维菌素等农药常规喷洒防治。
黄柏白霉病需用农药波尔多液或灭病威、杀毒矾、百菌清、大富丹按一定比例配比进行防治。
