按持股比例分配股权。新开的诊所其合伙人之间要有协议，规定合伙人之间的持股比例，有的合伙人是用现金入股，有的可能是多年积累的经验，形成自己的独特医疗技术，在附近群众中有一定的口碑。能吸引病患，用技术入股(协商折现)，有的合伙人用房屋入股，无论什么形式入股，都折现，按总股本的金额与每个人的持股金额，计算持股比例，盈利后按持股比例分红。
新开的诊所合伙人如何分配股权
1、按股东投入占比分红，规定不参与经营的股东没有额外的工资
股东投入资金，根据公司每年的运营业绩来分红，天经地义。但是面对那么夜以继日为公司打拼的股东，如果只是以每年的业绩进行分红的话，很显然有失公平。经营管理公司的股东劳苦功高，可以这样说公司的正常运转和后期取得卓越成绩都是由他们干出来的。所以，除了每年按股东投入资金占比分红外，还可以给予经营管理公司的股东更多的酬劳，即给予其与工作性质相应的年薪作为补贴。这样既能调动参与经营的合伙人的工作积极性，又能保证公司的健康稳步发展。同时不参与经营的合伙人也能获得每年的业绩分红。
2、按股东投入占比分红，不参与经营的股东没有额外提成
这个与第“1”点有类似之处，唯一不同的是，在对经营管理的股东进行额外的补贴时，主要参考其工作业绩，并非按照职位年薪的模式。
这种额外的业绩提成机制能让经营管理的股东更加的积极，在自己本职的岗位做的更出色。而站在不参与经营的股东角度，这种方式更易被接受一点。
3、将经营劳动转化为股份，对于不参与经营的股东减少其股份占比
更改按照投资金额的股份占比形式，减少不参与经营管理的股东的股份占比，这个机制比较敏感，尤其对不参与经营的股东来说，一旦实行了，等同于稀释了他们当初的投资金额。
但本着公司长期发展考虑，这种方法更加科学，对那些不参与经营的股东也相当有利，一旦企业发生重大的亏损，在承担企业亏损的责任时，也可按股份占比实行，减少那些不参与经营的股东的损失。
4、如果是有限公司或者是股份有限公司，那就按照你们的出资额在注册资本里面的占比来确定你们每个人的股权数额。
可以按比例分红了，例如：年终如有盈余按照投资比例分红，工资按照劳动、智慧付出多少协商确定，每月领取工资，工资与分红是两回事。工资可以是固定，也可以是基本工资加业绩提成。分红是在一个财务年度结束时有盈余的情况下按照投资比例分配。
