地下水含氟量的影响因素很多，如与地形、地貌、岩性与矿物成分、地下水径流、水化学类型、地下水温度、气候、自然界的理化作用、人类活动等因素密切相关。
在高、中山地区，含氟岩矿在风化、淋溶条件下，易被洪水冲刷流失，不利于氟的聚集而洼地和盆地地区，氟不易流失，有利于富集。所以地下水含氟量从高到低为盆地（洼地区）、平原区、丘陵区、高中山区。
在地下水径流强烈地区，地下水运动交替积极，有利于氟的迁移反之，则有利于氟的聚集。
倒置地下水含氟多的原因分自然因素和人为因素，其中人为因素更严重。
自然因素是因为地下含氟的矿石把氟原子渗出溶入地下水中，造成地下水中含氟升高。
人为因素是人类的一系列工化活动如冶金，化工，陶瓷和水泥，都会产生大量氟原子，这些氟原子被土壤吸收并溶入地下水中，造成地下水氟偏高。
另外农业活动中，一些化肥也含氟，也能让地下水氟偏高。
