想要提高孔雀鱼的生产质量，可以在鱼群1个月大的时候将公母分缸养，满3月龄再合缸，让它们开始繁殖。要识别孔雀鱼的公母，可以通过看尾鳍来区分，母鱼的尾鳍呈扇形，短而圆润，公鱼的尾鳍则长而分散，不是圆润的扇形。
孔雀鱼3~4个月就能达到性成熟，有些“早熟”的公鱼在1~2个月就会开始追着母鱼进行交配，但此时的母鱼体质还不稳定，最好等母鱼满3个月后开始繁殖，这样繁殖的成功率比较大，产下的小鱼苗体质健康成活率高。
生完小鱼的大鱼，要单独养5天左右再放回原缸中，以免受病，小鱼要分开饲养1个月左右才能放回去。
孔雀鱼容易辨别雌雄。雌鱼腹部比较大，在肛门前方有一块透明的胎斑，在快生殖的时候胎斑成黑色。而雄鱼的特点就是腹部较小，瘦长，最关键的就是其臀鳍演变出交接器，用于繁殖时候输送精子用。所以雄鱼的臀鳍前方的几根鳍条比较粗大。而雌鱼的臀鳍则是均匀的。
孔雀鱼性成熟迟早与水温高低、饲养条件密切相关，幼鱼经3-4个月饲养便进入成熟期可以繁殖后代。但是性成熟不是各项生理指标都成熟，要想生出好的下一代，必须雌雄分开，进入5个月龄以后再合缸，6月龄就能生产。不能用同一窝的幼鱼繁殖。一般以第二窝的子鱼质量最好，可以留作种鱼。
