苜蓿苗木生长发育缓慢，易受杂草和地下害虫的侵袭，应及时控制、培育和除草。同年杂草除草1-2次。杂草少的地块可以人工拔除，杂草多的地块可以使用化学除草剂。
在苗期播种前，可选用都尔、乙草胺、普施特等除草剂。剂量和用法可参考制造商的说明。苗期后可使用豆施乐、精禾草克等除草剂。苜蓿出苗后15-20天和杂草3-5叶期应施用除草剂。
施肥：紫花苜蓿有根瘤，它可以在空气中固定氮，并为自己提供氮。因此，应以磷肥为主，适当施用钾肥。在贫瘠荒地、盐碱地和土壤含氮量低的地区，播种时应施用尿素作种肥。
