区别在于状态不同：
一般溪流缸指的是模拟溪流的状态，因此往往水草比较少，石头比较多，有的水面会放浮萍。而原生缸主要和鱼有关，它主要复制了鱼儿原生态的环境，针对不同品种的鱼，原生缸的差别也很大，有的放贝类，有的种水草。值得一提的是，溪流缸一般被认为是原生缸的一种。
