不包括。企业养老保险是企业对职工的保障，根据比例企业和个人进行缴费。合作医疗又称为新型农村合作医疗，是为了减轻参合农民或自由工作者的医疗费用，是国家筹款的。
企业的养老保险里面交的是职工的医疗保险，那么职工的医疗保险是有年限的，跟新农合的医疗保险不一样，新农合的医疗保险是没有年限的，是一年交一次。那么你只要交费了你就可以使用，你不交费就不可以享受报销。
所以企业的养老保险里面不包括新农合的医疗保险，如果你在单位的话，那么单位给你交的五险一金的人包括的是职工医疗保险。你就不需要交新农合的医保了。
企业养老保险不包括合作医疗。企业养老保险包括的是职工医疗保险。医疗保险分为职工类型医疗保险以及居民类型医疗保险。职工类型，医疗保险顾名思义，也就是在单位上班的人员缴纳的医疗保险，以及缴纳灵活就业人员医疗保险的，属于职工类型医疗保险。
而居民医疗保险指的是没有职业的低收入人群缴纳的医疗保险，合作医疗就属于居民医疗保险，所以企业缴纳的社保里面不包含合作医疗。
