磁悬浮列车靠的的轨道的磁性和轮子的磁性相同使两者间大大减少磨差力，当列车启动时，给轮子通电，使产生和轨道相同的磁力，减小磨差力当需要停车时，给轮子通与原来相反的电流，使产生与轨道相反的磁力，两者相互吸引，就达到停车的目的。
1、正常运行停车：即系统没有需要停车的故障或问题，正常运行到车站停车。是使用轨道上的定子线圈中的牵引电流，进行反向力制动。
2、牵引切断停车：原因有多种，最常见的是轨旁牵引系统故障，或列车、信号系统出现需要切断牵引停车的故障。由于这时候没有牵引电流了，所以是利用车载电池的电力进行涡流制动，等列车速度低于10km/h时，再放下车辆。
3、立即停车：这种停车一般很少出现，它会使列车使用最大的制动能力和方式把车停住，所以停车位置是无法预判的。就是切断牵引，100%涡流制动，同时放下车辆、利用车辆底部的滑橇物理制动。在轨道末端的话，还会用到轨道末端的短路线圈。这种情况在系统可靠性计算中出现的概率小于十的负9次方。
