1、它们分布地区不同
闽南语，据传起源于黄河、洛水流域，在西晋时期、唐朝、北宋迁移至福建南部，发祥于福建泉州。
现主要分布地除闽南地区和台湾地区外，还广泛分布于闽东北地区、浙东南区、及广东粤东、粤西地区、海南岛及东南亚的大部分华人社群。
莆仙话分布于莆田市（荔城区、涵江区、城厢区、秀屿区、乌丘屿）、仙游县以及泉州市泉港区、福清市的部分地区。
2、使用人数不同
全世界使用闽南语的有7000多万人。
在莆仙地区和旁边的使用人口约500万。
3、音代表不同
闽南方言原以泉州府城音为代表，现以厦门音为代表。福建省以外各地通行的闽方言，基本上也属于闽南方言。
莆田话，是汉藏语系汉语族闽语支莆仙语（莆仙话）的一种方言。
