《沉睡的人鱼之家》讲述的是一场意外的游泳馆溺水事故，导致播磨和昌与熏子夫妇的七岁女儿瑞穗失去了意识，陷入了永久的睡眠状态。虽然经过抢救之后恢复了心跳，脑波却始终是一条直线，这就意味着大脑功能基本丧失，而且损伤是不可逆的，瑞穗不可能再恢复意识。
在这种情况下，医院的例行步骤是询问家属是否愿意捐赠器官，如果愿意，就要进行“脑死判定”，经过一系列检查之后确定符合脑死条件，就可以摘取器官，移植到有需要的病人身上。如果不愿意捐赠，那就“等死”——等心跳停止。
和昌夫妇究竟要如何抉择呢
