起始密码子是mRNA上的三联体碱基序列，决定翻译的起始，大部分情况下为AUG。
正常情况下，没有AUG，则翻译无法进行。
真核生物的起始密码子均为AUG（编码甲硫氨酸）而原核生物的起始密码子有三种：AUG、GUG和UUG，绝大多数情况下是AUG（编码甲酰甲硫氨酸），少数情况下GUG也可以是起始密码子。
但作为起始密码子， GUG也编码甲酰甲硫氨酸。
