主要是缺水，可以种棉花，但是要合理配置水资源。
塔里木河位于塔里木盆地北部。发源于天山山脉及喀喇昆仑山，沿塔克拉玛干沙漠北缘，穿过阿克苏、沙雅、库车、轮台、库尔勒、尉犁等县（市）的南部，沿最后流入台特马湖。
塔河主干最早曾注入罗布泊、后由于河流水量减少、河道摆动而改道、1972年以前尾水可达若羌县城北的台特马湖、后终点进一步退缩到铁干里克的大西海子水库。21世纪初开始全流域治理后，开始有水流复达台特马湖。塔里木河，是南疆地区的母亲河，天山以南的绿洲基本都是靠塔里木河水灌溉。
主要原因还是水分的缺乏，如在塔里木河干旱地区过度发展棉花生产，水资源必然匮乏灌溉用水增加，导致环境生态用水减少，荒漠化加剧，而且该地蒸发旺盛，不合理灌溉会产生土壤盐碱化，所以新疆的棉花的种植面积虽广，但却分布合理，并不是一味的扩张，棉花生长需要足够的热量资源和生育期的降水或灌溉条件
新疆是一个日照时间长、无霜期长、活动积温高的干旱地区，是一个特别适合棉花生长的地方，如今因为中国已经成为世界上最大的棉花种植国家。
