在鱼缸内养一些清洁类的鱼，例如清道夫、老鼠鱼等
清道夫
清洁鱼一般生活在鱼缸底层，平常不会游到鱼缸中上层，去打扰其它鱼类的生存环境，由于在底层，它们通常会在鱼缸底部觅食，沉到鱼缸底部的食物残渣和水中有机物，它们都能吃掉，另外在清道夫张嘴时，还会吞咽下鱼类的粪便。如果鱼缸内的杂质足够它吃个饱的话，它是不会傻傻的去吃鱼类的便便的，所以饲养清洁鱼，就应该让它发挥效果，不要喂食过多。
2、可以用网将鱼屎捞出
小鱼网
如果家里的鱼缸并不是很大，需要清理鱼屎的话，可以用渔网直接将鱼屎捞出，不过这样操作比较麻烦，而且用网的时候还容易伤到金鱼但如果主人没有更好的办法来清理鱼屎，这种最为原始的手动办法也是很有效的。
3、利用虹吸的原理，将粪便从缸底抽出
