1、种属不同
（1）斑桂鱼：属于硬骨鱼纲、辐鳍亚纲、棘鳍总目、鲈形目、鲈亚目、鮨科、石斑鱼亚科鱼类。
（2）花桂鱼：花桂鱼属于硬骨鱼纲、辐鳍亚纲、鲈形目、鲈亚目、真鲈科、鳜属鱼类。
2、形态特征不同
（1）斑桂鱼：斑桂鱼体呈椭圆形，侧扁，头部与口大，吻短而钝圆，有比较发达的铺上骨，表面鳞片较小，背鳍比较强健，体色会随环境变化而改变。
（2）花桂鱼：花桂鱼身体较厚且侧扁，背部隆起，头较尖，吻长大于眼径，体背侧为棕黄色，腹部为白色，表面鳞片为小圆磷，体表有许多不规则褐色斑块和斑点
