碗莲和菜菜两者品种不同，两者的根茎不同，碗莲的根茎较短，底下只有一截菜菜也就是菜莲，底下根茎较长，根茎能挖出很多截。
两者的叶子不同，碗莲叶子较大，叶柄粗壮菜莲叶子小巧，叶柄细弱。
花朵不同，碗莲花色为粉红色菜莲花朵为白色。种子不同，碗莲的种子会偏小一些，菜莲的种子要偏大一些。
