去主根瓜即将根部至短节部位结的幼瓜去掉即可(约10片叶之内)，去主根瓜是获得丰产的重要基础。
南瓜系异花授粉作物，在南瓜开花期蜜蜂较多，故多数靠蜜蜂自然传粉，省去人工授粉。但在留种田或南瓜开花期遇上阴雨，需辅助人工授粉。
方法是在上午10点左右摘去雄花抹在雌花柱头上即可，一朵雄花可抹2～3朵雌花，如将雄花扣在雌花柱头上更好。
南瓜的第一个花蕾多数是雄花，此时应将南瓜首次长的花骨朵及时摘下，最后等待南瓜的雌花生长即可。当雌花没有开放时，可以将温度提高，促进雌花开放，也可以对南瓜适当修剪，从而促进南瓜萌发更多的分枝，以此来促使雌花开放，还可以将雄花储藏到密封的罐子中，等待雌花开花后，再蘸取花粉涂抹到雌花上。
要摘去
南瓜开花初期一般先开的都是雄花，这时可以将雄花摘除，南瓜花也是可以吃的，待雌花开始开时就不用再摘了。一般每株保留2~3个南瓜即可，如果南瓜果型比较小的可以适当增加留果数量。南瓜坐果期水肥要充足，要及时进行追肥和浇水。南瓜病虫害较少发生，及时防除就不会影响产量。
