清理出来的鸡粪带着垫料堆积在一起用来发酵，夏天一般半个月左右，冬天需要两个月。发酵之后的鸡粪肥是很多蔬菜和果树最好的有机肥料，不过需要注意的是，鸡粪一定要发酵完全再施肥，不然会将植物的根烧坏。
根据新鲜鸡粪所含营养成分的不同，喂养的牲畜也不一样。喂猪和喂鱼都可以直接喂养，不需要进行其他特别的加工。
把新鲜的鸡粪晾晒干，然后加工粉碎，和其他饲料混合可以喂养猪、牛、羊等，不过一般不超过20%的添加量。鸡粪放入沼气池内发酵，经过半个月左右就可以发酵好，产生沼气做生活用，沼气废渣还能做肥料或者鱼饵。
发酵鸡粪作用：
1、建沼气池，生活生产的取火发电都可以，还可以用做鸡舍的保暖和照明
2、联系农场，做肥料，可以卖钱，养鸡形成一定规模时，鸡粪的处理和利用便很重要，鸡粪不仅是很好的肥料，还因为它含有较高的营养价值，可以作饲料，综合利用鸡粪，可以大大改善鸡场的卫生环境，消除蚊，蝇，臭气，减少疾病的传播，并能充分利用这个资源作饲料，肥料等，使鸡粪变废为宝，产生较好的社会效益，生态效益和经济效益，凡是养鸡地区都可以因地制宜，选择若干种方法实施
3、堆肥发酵法：通过堆肥发酵后的鸡粪，是葡萄，西瓜。
