主要原因是：在整个含水层或含水层的某些地段上，由于地下水的开采量长期地超过了补给量（即过量开采），逐渐消耗了储存量，并在一定周期内得不到恢复的结果。
在判断某一地区是否会出现区域性地下水位持续下降时，要特别注意它与降水补给周期性变化所引起的水位下降现象相区别。
地下水位下降的主要原因，就是工业用水、生活用水、农业用水的无节制开发利用，最近几十年的用水量，已经把过去几千年几万年自然界积累的水资源都消费掉了，所以有计划的利用水资源，有节制的开发水资源，是我们可持续发展的必修课之一。
其次就是地表植被的破坏，大气降水不能通过腐质层渗入地下，补充地下水，而是成为地表径流白白的流失，甚至造成洪水灾害。
地下水水位下降原因主要是人为因素和自然因素：
1、人为因素。人类的过分开采利用，由于过量的开采和不合理的利用地下水，常常造成地下水位严重下降，形成大面积的地下水下降漏斗，在地下水用量集中的城市地区，还会引起地面发生沉降。
2、自然因素。地震造成地势的抬高、地下河道的下沉等河流的改道气候的变化等，例如长期的气候干旱，农业灌溉和工业用水量的不断增加，造成地下水位普遍下降。
