没有本质区别。硝化细菌和硝化菌王本质上是一种东西，他们从成分和使用方法以及作用方面并没有本质的区别。这两种东西的主要作用就是增加水中的硝化细菌含量，使水体可以快速的形成硝化系统。在具体的使用过程当中，可以根据自己的经济状况选择性价比较高的使用即可。
区别在于，硝化细菌主要用来除去水中有毒的氨气。硝化细菌 ( Nitrifying bacteria ) 是一类好氧性细菌，包括亚硝酸菌和硝酸菌。生活在有氧的水中或砂层中，在氮循环水质净化过程中扮演着很重要的角色。
普通硝化菌是休眠的，放入水中后需要一定时间来恢复活性，而活性硝化菌放入水中当时就可以起作用。
