1、原料不同：甜酒曲是多用糯米制作的，白酒曲多数是用小麦制作，有些会加入大麦和豌豆，但主体多为小麦
2、菌种不同：甜酒曲中多以根霉菌和酵母菌为主白酒曲中多数以细菌为主，辅以酵母菌，根霉菌，毛霉菌等多种微生物共同生长
3、发酵温度不同：甜酒曲一般发酵温度为30℃，白酒曲中，分中温曲45—50℃，中高温曲50—60℃和高温曲60℃以上。
4、发酵时间不同：甜酒曲发酵60-72小时制成，白酒曲一般发酵时间在一个月以上，再根据不同的工艺确定存曲时间。
5、用量不同：甜酒曲一百斤粮食一般用量为0.5-1斤，白酒曲中用量为粮食用量20%-100%。
